谷歌的人工智能可预测蛋白质的三维形状

　　原标题：谷歌的人工智能可预测蛋白质的三维形状 在坎昆举行的结构预测评估（casp

　　原标题：谷歌的人工智能可预测蛋白质的三维形状

　　在坎昆举行的结构预测评估（casp）国际竞赛上，该比赛的组织者宣布，谷歌旗下deepmind公司最新的人工智能程序alphafold在预测蛋白质（即生命的基本份子）的三维形状中打败了所有竞争对手。

　　人工智能络图

　　“蛋白质折叠”是一种不可思议的的分子折叠形式，虽然科学界很少对其进行讨论，但它仍然是一个非常重要的问题。生物个体是由蛋白质构成的，蛋白质的形状决定了它的功能。弄清楚蛋白质是如何折叠的，就意味着研究人员可以首创科学和医学进步的新时代。

　　人体可以制造大约十亿种不同的蛋白质，它们每一种都包含氨基酸链，能够以20种不同的形态出现。蛋白质可以在每一个氨基酸之间扭曲和曲折，因此具有数百个氨基酸的蛋白质有可能出现出数量惊人的不同结构：可能会围绕成一个4维立方体，或是出现 00个零种形态。

　　蛋白质采用的 d形式取决于它所含氨基酸的数量和类型，而它的形状决定了它在生物体内的作用。例如，心脏细胞点缀着折叠的蛋白质，使得血液中的任何肾上腺素都能粘住它们并使心率上升。同时，免疫系统中的抗体是折叠成特定形状的蛋白质，这些蛋白质可以阻挡入侵的病菌。几近身体的每个功能，从紧张肌肉和感应光到将食物转化为能量，都可以追溯到蛋白质的形状和运动。

　　一般情况下，蛋白质具有最节能的形状，但它们的缠结和错误折叠，会致使糖尿病，帕金森氏症和阿尔茨海默病等疾病。如果科学家能够从化学成分中预测出蛋白质的形状，他们就可以弄清楚其作用，和它可能会造成的伤害，并设计出治愈方案或为其他领域给出解决办法，比如打破环境中的塑料污染。

　　deepmind将alphafold引入了结构预测评估（casp）竞赛，这项竞赛可以算得上是蛋白质折叠大赛界的奥运会，一年举行两次，吸引了来自世界各地的研究团体。竞争需要从氨基酸列表中预测蛋白质的结构，连续数月每隔几天这些氨基酸列表就被送到每个团队的手中，提交最准确预测的团队获胜。

　　在首轮比赛中，alphafold在98名参赛者中排名第一，其预测的4 种蛋白质中有25种蛋白质的结构最准确，而同一类别中排名第二的队伍中有4 种结构中只有 种预测的最为准确。

　　为了构建alphafold，deepmind在数千种已知蛋白质上构建了一个神经络，直到它可以预测单独使用氨基酸的 d结构。鉴于要研究的是新蛋白质，alphafold使用神经络预测氨基酸对之间的距离，以及连接它们的化学键之间的角度。随后，alphafold调剂草图结构以找到最节能的布置。alphafold花了两周时间来预测它的第一个蛋白质结构，但现在它只需要几个小时就能预测到结果。

　　雷丁大学研究员liam mcguffin表示：“能够预测出蛋白质折叠形状，对解决许多21世纪的问题具有重大意义，它能够影响健康、生态、环境，并基本上能够解决任何涉及生命系统的问题。”